Révélé notamment via son ouvrage sur le développement local paru en 1989, dans lequel il analyse les facteurs permettant la réussite des projets de développement, Bernard Pecqueur a consacré sa carrière de chercheur à décortiquer toujours un peu plus les notions d’aménagement ou de ressources territoriales, se plaisant à explorer divers terrains d’enquête de la France au Brésil.
Sur ces sujets, il est l’auteur de très nombreux ouvrages. Citons notamment « Les living Labs. Une perspective territoriale » avec Juan-Luis Klein (Harmattan, 2020), « Renouveler la géographie économique », avec Magali Talandier (Economica, 2018), « Le développement territorial » aux éditions Charles Léopold Mayer (2014), avec Pierre Campagne ou encore « L’Economie territoriale », avec Claude Courlet aux Presses Universitaire de Grenoble (2013).