Signataire du Contrat de Plan Etat-Région qui a créé et financé la Mission Agrobiosciences (Direction Générale de l’Enseignement et de la Recherche), le Ministère de l’Agriculture et de la Pêche l’a également sollicitée, d’une part via sa Direction Générale de l’Alimentation pour la conception et l’animation des Etats Généraux de l’Alimentation organisés par le gouvernement, d’autre part pour la conception et l’animation de ses débats, sur son Forum de débats, lors des différentes éditions du "Salon International de l’Agriculture". Le service central de communication du Ministère a enfin sollicité la MAA pour accompagner l’élaboration d’un projet global de communication sur la base d’un débat intégrant pleinement ses services déconcentrés.

Signataire du Contrat de Plan Etat-Région qui a créé et financé la MAA, le Conseil Régional Midi-Pyrénées lui a par ailleurs confié à plusieurs reprises la maîtrise d’oeuvre des Rencontres Agriculture, Alimentation et Société organisées dans le cadre de la SISQA ainsi que l’organisation de débats lors de réflexions collectives engagées sur la Culture scientifique et technique.